MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017788	TAT	3	9	4	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858755
2	NC_017788	TCT	2	6	36	41	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858755
3	NC_017788	TAA	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858755
4	NC_017788	TTG	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858755
5	NC_017788	ATTC	2	8	80	87	25 %	50 %	0 %	25 %	386858755
6	NC_017788	ATT	2	6	98	103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858755
7	NC_017788	ATT	2	6	116	121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858755
8	NC_017788	ATAA	2	8	154	161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017788	AT	4	8	164	171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017788	A	6	6	173	178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017788	A	6	6	180	185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017788	TTA	2	6	197	202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017788	T	6	6	207	212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017788	AT	3	6	237	242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017788	TAA	2	6	269	274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017788	CTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017788	ATT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017788	TAA	5	15	354	368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017788	ACA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017788	A	7	7	444	450	100 %	0 %	0 %	0 %	386858756
21	NC_017788	T	8	8	483	490	0 %	100 %	0 %	0 %	386858756
22	NC_017788	CTT	2	6	557	562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858756
23	NC_017788	TAT	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858756
24	NC_017788	GTTTTA	2	12	576	587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386858756
25	NC_017788	AT	3	6	588	593	50 %	50 %	0 %	0 %	386858756
26	NC_017788	TAA	2	6	622	627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858756
27	NC_017788	TCT	2	6	630	635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858756
28	NC_017788	TA	3	6	671	676	50 %	50 %	0 %	0 %	386858756
29	NC_017788	A	6	6	714	719	100 %	0 %	0 %	0 %	386858756
30	NC_017788	TCC	2	6	737	742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858756
31	NC_017788	TA	3	6	746	751	50 %	50 %	0 %	0 %	386858756
32	NC_017788	TCT	2	6	769	774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858756
33	NC_017788	TA	3	6	802	807	50 %	50 %	0 %	0 %	386858756
34	NC_017788	ATT	2	6	821	826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858756
35	NC_017788	T	6	6	825	830	0 %	100 %	0 %	0 %	386858756
36	NC_017788	TTC	2	6	854	859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858756
37	NC_017788	TCA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858756
38	NC_017788	ATT	3	9	902	910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858756
39	NC_017788	TTA	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858756
40	NC_017788	TAT	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017788	TTA	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017788	T	6	6	1010	1015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017788	TAA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
44	NC_017788	ATA	2	6	1062	1067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
45	NC_017788	ACA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858757
46	NC_017788	TCT	2	6	1119	1124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858757
47	NC_017788	T	8	8	1194	1201	0 %	100 %	0 %	0 %	386858757
48	NC_017788	TAA	3	9	1213	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
49	NC_017788	CTT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858757
50	NC_017788	CA	3	6	1310	1315	50 %	0 %	0 %	50 %	386858757
51	NC_017788	ACT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858757
52	NC_017788	AATTT	2	10	1402	1411	40 %	60 %	0 %	0 %	386858757
53	NC_017788	TAA	3	9	1452	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
54	NC_017788	ATTCA	2	10	1466	1475	40 %	40 %	0 %	20 %	386858757
55	NC_017788	TAT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858757
56	NC_017788	TAA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
57	NC_017788	TA	4	8	1564	1571	50 %	50 %	0 %	0 %	386858757
58	NC_017788	GTA	2	6	1626	1631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858757
59	NC_017788	ATC	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858757
60	NC_017788	ATT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858757
61	NC_017788	T	7	7	1757	1763	0 %	100 %	0 %	0 %	386858757
62	NC_017788	T	7	7	1786	1792	0 %	100 %	0 %	0 %	386858758
63	NC_017788	AAT	2	6	1840	1845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858758
64	NC_017788	T	6	6	1880	1885	0 %	100 %	0 %	0 %	386858758
65	NC_017788	AGA	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858758
66	NC_017788	TA	3	6	1912	1917	50 %	50 %	0 %	0 %	386858758
67	NC_017788	A	6	6	1920	1925	100 %	0 %	0 %	0 %	386858758
68	NC_017788	TAC	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858758
69	NC_017788	T	6	6	1933	1938	0 %	100 %	0 %	0 %	386858758
70	NC_017788	ATA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858758
71	NC_017788	TCT	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858758
72	NC_017788	T	6	6	2018	2023	0 %	100 %	0 %	0 %	386858758
73	NC_017788	ATA	2	6	2041	2046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858758
74	NC_017788	T	7	7	2098	2104	0 %	100 %	0 %	0 %	386858758
75	NC_017788	A	6	6	2131	2136	100 %	0 %	0 %	0 %	386858758
76	NC_017788	AT	3	6	2197	2202	50 %	50 %	0 %	0 %	386858758
77	NC_017788	CTT	2	6	2214	2219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858758
78	NC_017788	TGT	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858758
79	NC_017788	AT	3	6	2265	2270	50 %	50 %	0 %	0 %	386858758
80	NC_017788	TTAA	2	8	2283	2290	50 %	50 %	0 %	0 %	386858759
81	NC_017788	T	6	6	2313	2318	0 %	100 %	0 %	0 %	386858759
82	NC_017788	CAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858759
83	NC_017788	T	7	7	2385	2391	0 %	100 %	0 %	0 %	386858759
84	NC_017788	TCT	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858759
85	NC_017788	T	6	6	2447	2452	0 %	100 %	0 %	0 %	386858759
86	NC_017788	TCTCT	2	10	2496	2505	0 %	60 %	0 %	40 %	386858759
87	NC_017788	T	8	8	2510	2517	0 %	100 %	0 %	0 %	386858759
88	NC_017788	T	6	6	2519	2524	0 %	100 %	0 %	0 %	386858759
89	NC_017788	T	7	7	2526	2532	0 %	100 %	0 %	0 %	386858759
90	NC_017788	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858759
91	NC_017788	TAT	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858759
92	NC_017788	T	6	6	2600	2605	0 %	100 %	0 %	0 %	386858759
93	NC_017788	TGT	2	6	2618	2623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858759
94	NC_017788	GT	3	6	2622	2627	0 %	50 %	50 %	0 %	386858759
95	NC_017788	TTGCAT	2	12	2646	2657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386858759
96	NC_017788	CAA	2	6	2664	2669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858759
97	NC_017788	TATT	2	8	2714	2721	25 %	75 %	0 %	0 %	386858759
98	NC_017788	TATG	2	8	2734	2741	25 %	50 %	25 %	0 %	386858759
99	NC_017788	TAA	2	6	2764	2769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858759
100	NC_017788	T	7	7	2772	2778	0 %	100 %	0 %	0 %	386858759
101	NC_017788	AAT	2	6	2779	2784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858759
102	NC_017788	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858759
103	NC_017788	ATT	2	6	2834	2839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858759
104	NC_017788	TTGA	2	8	2900	2907	25 %	50 %	25 %	0 %	386858759
105	NC_017788	TGT	2	6	2952	2957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858759
106	NC_017788	ATTT	2	8	3011	3018	25 %	75 %	0 %	0 %	386858759
107	NC_017788	AAT	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017788	TA	3	6	3086	3091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017788	TA	3	6	3103	3108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017788	T	6	6	3151	3156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017788	TA	3	6	3159	3164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017788	TTTA	2	8	3167	3174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.